由于对左良玉失望透顶，朱由检在这次御前军事会议上甚至都懒得提他。
“诸位爱卿眼前的国朝局势危若累卵，但咱们不能因急而生乱，要有定力。朕认为当前的大局稳字当先，已经糜烂了的省份，暂且可以先不管。但还算安稳的省份，务必要保持稳定不可再使其进一步糜烂。现下、中原、湖北已乱、川南、云贵、广西亦有乱象，像湖南、山东、陕西、山西同样不安稳。这些地区治乱才是当务之急。朕认为当下之乱局，在治不在剿。治是在除根、剿是在割草。不除根，就会出现春风吹又生的现象徒耗国力而已。”
“陛下所言甚是，国朝局势之所以越来越乱，确实是咱们只注重剿而不注重治，老臣亦以为戡乱救国当以治为重。”周延儒顺着杆子表达了自己的主张，他自己也不懂军事，若是一味的想用军事手段解决内乱，只会让兵部的权势越来越重，这对内阁来说并不是期望发生的事。大明财政近九成花到了军事上，这绝对是不健康的，也是其它口子的官僚不想看到的现象。
“确如太师所言，当以治为重！但治也要有个方略，不能眉毛胡子一把抓，得有重点，要划定一个基本盘，先将重点省份治好，然后步步为营稳扎稳打，力求用五到十年之功使大明实现中兴。两直是国之根本，亦是割除痹症实现中兴的关键。以两直为支点、以运河为主轴，必须要在五年内革除痹症，回复到原本的模样。朕的计划是今年年底之前在北直隶率先进行中兴改制的试点，希望各位爱卿能全力支持朕的改制计划。等北直隶地区改制有了效果和经验，再往全国逐步推行。”
改制？咱们本来议的是如何灭贼和恢复治政，怎么说了半天被弄成了改制？皇帝所谓的改制到底是什么内容啊？底下的朝臣们心里有些不踏实了。