青龙军团也算是一个特殊单位，因为将来会给他们配备许多舰船，并且是以登陆部队为主，他们主要是配合海军进行登岛作战，同时他们还会分的很散，毕竟太平洋上的岛屿太多了，虽然不需要每一座岛屿驻扎人手，但是在一些关键的地方还是需要让他们驻扎的。
最后就是黄龙军团了，这个人数最少，但是也是最精锐的部队，在防卫京畿地区的同时还要负责军官的培训，职业士兵的培养等等各方面的工作，可以说将来的黄龙军团特别重要，不仅仅是他们的士兵都是从各大军团挑选，还担任一项重要的职务，那就是以后各大军团里的军事主官都会从这里派遣，也就是说将来谁掌握了黄龙军团，谁就掌握了大明的陆军部队。
同时黄龙军团的会组建五支特种部队，其中四支特种部队对应的就是其他军团的特种部队，而王牌中的王牌就会专门组建成为了一支特种部队---睚眦特种部队，取睚眦必报的意思。
黄龙军团的军团长将会由最忠心皇室的将领担任，在没有合适的人选前，就由朱舜兼任，将来会逐渐交给其他人。
对应改革的还有五军都督府，在明朝前期五军都督府是统帅整个大明军队的最高行政机关，后来因为防止五军都督府权力过大，就逐渐没落了，再加上文官从中作梗，五军都督府的权力逐渐集中到兵部那里，这就造成了军权旁落，皇帝也就失去了对军队的控制权。
到了朱舜出现之后，五军都督府虽然收回了部分权力，但是主要作用就是参谋，也就是相当于后世的参谋部。
不过现在随着军队越来越向近代化靠拢，需要设立一些新部门的同时也需要把臃肿的五军都督府进行拆分。
五军都督府的名称不变，不过是五个部门的统称，后军都督府，主管军队的后勤，相当于后勤部，前军都督府，主要的作用就是收集敌方的情报，相当于后世的军事情报机构，左军都督府主管的是军队的训练以及军籍等事项，右军都督府主管军队的刑罚，相当于后世的纠察部门，而中军都督府比其他都督府高半级统领其他部门，并且根据皇帝的命令制定相应的战略计划，也就是专业的参谋部门，这样以来五军都督府的职能就划分的很清楚了，已经和后世的参谋部相差无几了。