自秦朝以来，古代一直都是实行郡县制，各省的官员都由中央政府选拔并任命，中央政府可以随时决定官员的去留和升降奖惩，这种将官员任免权集于中央的做法抑制了地方势力的做大，维护一统。
而西南地区的土司制，恰恰就与这一原则完全相悖。在西南地区，土司世袭罔替，握有当地的军政大权，对于中央仅有定时缴纳赋税的义务，中央无权决定土司的任免和选拔。
在土司统治下，土地和人民都归土司世袭所有，土司各自形成一个个势力范围，司法、财政、行政、兵事都可以自治，对于当地人民予求予取，掌握一切生杀大权，除了不能登基称帝，其他一切甚至比照皇帝，而且只需要象征性的向朝廷缴纳微薄的赋税。
土司制度与中央集权如此格格不入，本该早就淘汰进历史垃圾堆里。但无奈西南贫瘠，山道险峻，又布满了瘴气毒虫，武力征伐实在是成本太高，因此历代帝王，只要土司们不明面上反抗中央，也就更多是听之任之。
到了明朝时，土司制度达到了顶峰，最后尾大不掉，严重威胁到朝廷统治和国家统一。
万历年间土司杨应龙叛变，几经周折才平定下去。明朝皇帝因此动了“改土归流”的念头，但国事蹉跎，明朝还来不及推行相关政策，便亡国了。
李存明穿越而来，想要拯救大明朝，就不能对威胁国家统一的土司制度视而不见。
随着西征取得了完全的军事胜利，是时候清除这一颗毒瘤了，必须将”改土归流“的政策贯彻下去！
所谓的改土归流，就是指将土司制改为流官制，将统治权交由中央直接管辖。随之进行清查户口、丈量土地、核实赋税等工作，并从内地移民来西南地区开荒，逐步加大汉人与少数民族的融合。
了解这些基本的历史事实和背景，便能理解土司们为何竭力反对改土归流的政策，这是在砸他们的饭碗，动他们的蛋糕。