册封郑芝龙等于是让朱慈炯被迫认可了郑家对于福建沿海的统治地位，郑家的旗号就是商船的买安权，挂大明的旗号却未必能免了被劫掠的风险，朱慈炯如何能够忍受！
郑芝龙的海军名义上是大明的官军，可所作所为与海盗有何区别？只怕朝廷稍不顺从其意，便会叛出大明，想来在郑芝龙的眼里，大明新军固然强悍，但海上终归以他为尊，天子诏书与他而言，与废纸又有何不同？
海疆是大明的海疆，不是郑家的！朱慈炯要想现实海洋霸权，彻底走在世界的前列，郑氏就是拦路虎，是必须清除的目标！
以前朱慈炯没有底气更没有必要去收拾郑芝龙，因为他还需要郑芝龙在大明海军崛起之前，抵御荷兰诸国，让沿海百姓免受异邦荼毒，但现在已经没有必要，换言之，现在的郑芝龙对于朱慈炯来说已经没有丝毫利用价值！
如今大明第一舰队拥有钢铁巨舰十二艘，火炮数百门，郑芝龙即便带甲数万，战船三千艘，在朱慈炯的眼里与土鸡瓦狗也没多大区别！两者之间根本没有对比性，就好像是一个浑身挂着利刃的孩童，对着大明这个巨人张牙舞爪，而巨人想要击溃这个孩童，无非就是一拳一脚的问题罢了。
“郑芝龙……”朱慈炯喃喃念道。
“启禀陛下。”史可法硬起头皮道：“南安伯驻镇福建，这些年来还算勤勉，抵御荷兰等国更是成效卓著，臣以为可下旨让其入京，大加褒奖……”
朱慈炯眼神微微一凝，史可法想来已然知道了自己的盘算，明白他绝不可能放任郑氏霸占沿海，阻扰官民贸易，因为出了这么一条毒计，召郑芝龙进京，那郑芝龙还能回的去吗？而且郑芝龙敢来吗？
历史上郑芝龙向满清贝勒博洛投降，最终却被移送到北京软禁长达十几年，最后因其子拒不投降，故而被下狱直至被杀，今世难不成也逃不出被软禁的命？