达赖五世入京抱着什么样的心思，朱慈炯多少能猜到一些，大明崛起，固始汗撤军，显然给达赖五世造成了极其巨大的压力，不管达赖是想要保住教权还是想更进一步涉及政权，金陵他都必须来一趟，摸清朱慈炯的态度！
朱慈炯对达赖五世不算太了解，但多少也知道一些，达赖五世不像三世、四世那样彻头彻尾就是个苦行僧，不但不热衷于世俗权力，即便对教权的掌控也是宽松到了极点，而五世正好相反，不但想要将教权牢牢掌控在手，对于世俗权力同样热衷，大明崇祯后期，固始汗对于乌斯藏的统治极其稳固，达赖五世不可能从固始汗手里获取到他想要的一切，但历史上随着大明灭亡，满清成为统治者以后，固始汗掌控力度减弱，这一切多少发生了一些改变。
满清将乌斯藏纳入统治以后，改乌斯藏为西藏，对西藏实行的政策一样是政治、宗教权力分开，但实际上达赖五世还是参与了西藏地方的政治事务，并且掌有一定的实权！
甚至于在固始汗去世后，达赖五世还拿到了官吏的任免权，并在顺治十七年首次委任第巴高级行政官员，这便是历辈达赖喇嘛过问政治事务的开始。
达赖五世不仅授给许多寺院自行管理寺属庄园和属民的权力，还以皇帝的名义分封土地，甚至交给寺院独立司法的特权！
也正是因为这样，各教派的上层人士就变成了既是信教者，又是官员双重身份的出家人，老百姓称之为‘喇本’……
满清时代，顺治皇帝给固始汗的诏书中说‘盖矢忠诚，广宣声教，作朕屏辅，辑乃封圻’，意思就是让固始汗保卫西藏边疆，将所敕西藏封地治理得和睦安宁，而对达赖五世，清廷则封为‘所领天下释教’的宗教领袖！
顺治十年达赖五世到达北京，被赐金册、金印，和硕特汗通过派使者，送达赖进京抬高汗廷政治地位，达赖五世也借此提高黄教的宗教地位，清朝也通过册封达赖喇嘛，掌握住了这位黄教领袖！