为了控制这瘟疫的传染范围，杨云让县衙在吴县县城中发布告示。建议吴县百姓，暂停大型嫁娶婚姻、寿宴，不举行大型集会，不到人多的地方去，等一系列措施。
有了杨云的一系列策略，瘟疫的传播速度慢慢降了下来，新增的得病病人，慢慢减少了。
但是，现在摆在杨云面前最大的困难是如何治疗这些已经患病的病人，杨云用心开出的药方。在县衙让县兵们熬成中药，给这些患病的病百姓服用后，许多人的病情得到明显的好转。
有一些症状比较轻的老百姓，甚至已经慢慢康复了。但是，对于一些重症病人而言，这药的效果，还不够明显。这几日，来又有好些人，没有人熬得住，被病魔带去了生命。
这些死去的病人，虽然大多数是一些，抵抗能力较弱的老人，但是这也给杨云很大的挫败感。
目前这种情况下，杨云只的硬着头皮，继续进行研究。在和县城中一些经验丰富的大夫讨论之后，杨云调整了一些药材，并且加大了用药的剂量，这样一来，效果明显好多了。
又有一批病情较为轻微的病人被治愈，还有一些，十分严重的病人病情也在慢慢好转。看到这一现象，杨云和一起忙碌的这些大夫们，终于露出了笑脸。
但是新的麻烦又接踵而至，吴县虽然处于大山之中，各类药材的储备非常丰富。但是面对着数千人大面积的，染上了瘟疫，药材仍然开始吃紧了。
由于药材供应不足，医馆的大夫们只得减少了，病人的用药剂量。这样一来，药效又差了起来，一些病情已经慢慢好转的百姓，他们的症状又出现了反复。
杨云找来了钟文睿，刘远以及姚侠等人，和他们商量如何寻找药材这一棘手问题，最后大家集思广益，有了这样几个思路：
第一，充分发挥吴县百姓的积极性，让他们把自己家里存着的草药都拿出来。