14时25分，“扬武”号以主炮命中“杜居士路因”号的舰桥，重达150磅的炮弹把单薄的舰桥彻底摧毁，舰长及所有舰桥人员7死17伤。
“扬武”号上响起一片欢呼声——明军眼看敌舰舰桥消失在火海中，误以为已经干掉法军指挥系统了。
法国人始终没有挂将旗，这让明军上下大部分人都产生了误判。
但是随后，“杜居士路因”号就以一发190mm炮弹还以颜色，这枚炮弹从炮舰“永保”号右舷前方穿入，沿途击穿所有甲板隔层，一路钻进锅炉房才爆炸！
战后，当时跟在“永保”号后面的“琛航”号上，一名补充来的海校学员这样描述接下来的场景：
“永保前方中弹，随后剧烈哆嗦起来，烟囱周围冒出大量黑色煤烟，一开始没有看到火光，我还以为是交通艇在燃烧，不过它慢慢停了下来，我们不得不打左满舵，从永保身边绕过去，但当我们平行的时候，永保爆炸了……”
炮弹引发“永保”号锅炉爆炸，仿佛有一条火龙从其舰体中部击穿甲板窜上半空，这艘标准排水量1260吨的炮舰迅速淹没在浓烟和烈焰之中，各种细碎的零件被抛向天空又如雨般洒落，甚至造成“琛航”号上5人受伤。
事后只有1名幸存者游泳回到岸上，另有两人被福建地方水师的福船救起，包括临时上舰补充缺额的海校学员在内，110名官兵中有107人阵亡。
“永保”号的沉没不仅使明军损失了一艘主力舰，还是法军反攻的号角。
趁着明军主力围攻“杜居士路因”号的机会，其他8艘法舰全部进入马尾港，周边的岸上炮台和明军第二舰列发炮阻击，但5艘小型炮舰上区区10门70磅前膛炮无法给法军造成任何威胁，海岸炮台的18磅红衣炮就更不用提了。
8艘法舰转向后，立刻以侧舷全部火力轰击明军，炽热的火力迅速淹没了单薄的明军第二舰列。