对于北大的学生来说，他们早就不满于北洋政府久矣。一方面是北洋政府把北京大学当成了安置裙带私人的一个安乐窝了，把那些没有学问的亲朋好友安插在北大当教授讲师领取高额薪水，或是把那些亲朋子弟送来北大镀金，打算在这里捞一个文凭再安排到政府里去。
在蔡元培没有担任北大校长之前，在北大就读的执绔子弟和没有品德的北大教授在八大胡同为了妓女打架，曾经是京城出了名的笑话。
另一方面就是，辛亥革命之后国门大开，从海外传回的各种新思想和新科学已经打开了年轻人的头脑，可是北洋政府却依旧试图延续满清的愚民政策，在大学里教导四书五经，而不讲外国的科学和思想，这显然就是在把这些中国最有前途的年轻人当猪养了。
因此蔡元培担任北大校长之后推动的对于北大的改革是深受进步师生的欢迎的，而这一次共和党对已经退位的清室提出控告，则极大的鼓舞了北大的进步学生，让他们把本日里的不满都发泄了出来。
从得知共和党的控告开始，北大的进步学生们就开始了在学校内不断的集会演讲，不仅在于批评满清的腐朽无能，还将之前日本侨民在上海制造的冲突事件也归罪于北洋政府的治国无能上了。北大学生不仅仅在自己的学校内进行演讲，还联络了北京各所大学的学生。
随着学生联合运动的不断扩大，到了9月29日，北京各所大学一千多学生和从天津赶来的学生代表终于从学校中走了出来，跑到了新华门外对总统进行请愿。
由于学生中有着共产主义青年团的团员带头，因此这支游行队伍从北大绕过大半个紫禁城走到新华门外时，一路上不仅打出了标语，还在沿途向北京市民宣传了自己的主张。学生们的主张很是明确：“收回租界，废除治外法权；打倒慈禧，废除庚子赔款。”