大军休整的地点在北九州，因为陈坚下一步攻伐本州岛是从关门海峡对面的下关开始，所以才将休整的地点选择在北九州，到时候不用劳师远征，渡过海峡就可以开干。
在北九州休整了两个月，顺便过了个年，正月十五刚过，征伐本州岛，对倭国的灭国行动即刻展开。
由于九州岛上的势力全都被清除，基本只剩下一些种地的农民以及匠人，整个九州岛的局面短时间内绝对没有任何反复的可能。所以，此次征伐本州岛，乃是全军出动，兵力超过十万。当然，九州岛也不会完全不管，陈坚把管理九州岛的任务交给了李根。经过几个月时间的大力砸钱，李根已经招募到了上万人马，能不能打仗不知道，压住九州岛这个阵脚，使得整个九州岛保持稳定的局面是没有任何问题的。这样做同时也是为以后做准备，毕竟陈坚不可能亲自来管理倭国，而手下也没有合适的人选，那么比较靠谱的就只有李根了。虽然李根也没有相关的经验，但陈坚能够看出其是一个颇为稳重的人，只要自己稍微提点一番，相信李根是能够胜任的，至少不会引起什么大乱子，这就够了。
正月二十，陈坚率领十余万大军渡过关门海峡，正式开启了征服倭国的征程。
此次的目标主要是京都的天皇和江户的德川幕府，所以对本州岛陈坚并不准备像在九州岛一样将各个地方势力全都清理干净，只有正好处在行军路线上的各个大名才会成为大军的目标。
本州岛各藩的实力与九州岛上的差不多，根本对东征大军构不成任何障碍，即便部分地方有比较坚固的城池，在火药和大炮面前同样没有卵用。大军推进得非常顺利，平均每天至少能向前突进一百里以上，半个月后，大军就已经攻下了大坂。
大坂距离京都只有一百多里地，现在马上就要对天皇下手了。不过为了不给自己招仇恨，陈坚并不准备率大军攻打京都，因为倭国天皇虽说没有任何实权，但在倭人心中却有至高无上的地位，因此，若是明目张胆地率军攻打京都，必定会招致包括倭奸部队在内的绝大多数倭人对自己这支军队的仇恨，说不定还会导致大岛健次郎这样的人背叛自己，而且对今后统治倭国也可能造成严重的负面影响，那样的话就亏大了。所以，要对付天皇，只能采取相对阴暗的手段，为了尽可能地不为人知，陈坚决定就由自己一个人来解决问题。