此次的征讨行动就不再向以前一样打完就走了，而是每打下一处地方都会留下一定数量的部队对这一地方实施军管，所有俘虏则全部充入征讨大军，这样做就是将征讨大军的人马与各地原有的各藩人马进行置换，在每个地方都有可靠人马留守的情况下，征讨大军的规模也能够得以保持。
对于参与留守各地的大明籍士兵，陈坚是按照大明建国初期的军屯制度来安排他们的，将当地的土地划一部分给他们，种地的事则由原来各大名名下的农夫负责，留守的士兵除了维护当地的稳定之外就是做翘脚地主。同时，给每个人免费送倭国老婆的事也一并兑现，多数人都不止一个，所以，他们还有一个重要任务就是生孩子，尽可能增加汉人在整个倭国国民中所占的比例。
虽然是搞军屯，但陈坚向他们郑重声明，这绝不是让他们做大明那种军户，他们的后代也不会像大明军户那样在多方面受到严格限制，而是可以凭自己的努力追求任何理想的前途，包括做朝廷高官。而且，军屯制度也只是暂时性的，等到倭国彻底平定，局面逐渐稳定之后就会慢慢裁撤，绝对不会像大明那样延续几百年的。
在那些培养出来的将帅基本具备了自主作战能力之后，陈坚终于能够从军中抽出手来，此时已经过去了几个月，首批从大明邀请的读书人已经抵达了东京。
这些读书人都是新手，陈坚有必要给他们上上课，虽然对倭国的治理陈坚并不是非常在意效果，但也绝对不能完全当儿戏，让这些读书人统一思想，向他们灌输一些关于治理方面的基本原则是必须的。
这些读书人都早已经知道了陈坚的身份，所以，对于陈坚要给他们上课，没有一个人有抵触心理，反而觉得是一种莫大的荣幸。这不光是因为陈坚的身份和地位，更主要是因为陈坚可能是神仙的那个流言。陈坚的不老神话早已经传遍了大明，这些读书人自然早就听过这个流言，本来还以为是以讹传讹，此刻见到陈坚的真身，方知那根本就不是流言，而是实实在在的事实，这就让众人心中不期然地会产生一种特别的感觉，觉得眼前的人不是凡人，而是天上的神仙下凡，现在神仙要给自己上课，哪敢不用心聆听？又哪敢将神仙的话当耳边风？