而对于爪哇，加里曼丹和吕宋这些地方，将会全部交由当地华人自治，并会通过传统的方式由大明朝廷册封当地华人领袖作为该区域的主人。也就是说，今后的东南亚，将会像后世一样分成若干个大小不等的独立国家，而华人将成为这些国家的主宰。
此时巴达维亚的华人领袖是苏定邦，是前甲必丹苏鸣岗的孙子。对于陈坚将巴达维亚交给自己来管理，苏定邦非常的意外，听说将来还能得到大明朝廷的正式册封，更是喜出望外。自此，苏定邦对陈坚可谓是言听计从，对于陈坚的身份，苏定邦从未怀疑，虽然远在东南亚，但大明这几十年所发生的大事苏定邦却是知道的，对于陈坚此人苏定邦也早就听说过，陈坚长生不老的传言苏定邦自然也有耳闻。看着眼前这个明明有着七十多岁年纪却保持着三十多岁状态的神仙般的人物，苏定邦心里只有满满的膜拜，根本生不起一丝怀疑之心，其所说的一切皆算得上仙人的指引，苏定邦又哪敢有丝毫违逆？
陈坚建议苏定邦组建自己的军队，一则以此巩固自己的统治地位，二则是为统一整个爪哇岛做准备。首批士兵的来源就是原巴达维亚酋长的军队，那些没有被杀掉的都交给苏定邦，让其组织自己的华人亲信进行指挥调度。同时，陈坚还给出了管理那些土著士兵的基本原则，那就是必须铁腕治军，凡是有不服从指挥或是其他惫懒亦或是闹事的行为的，就一个字，杀，杀到所有人都彻底服帖为止。
另外，陈坚还根据自己的经验向苏定邦提出了以土著制土著的建议，就是对土著实行分等级管理，越是先归顺的，忠诚度越高的土著等级就越高，反之等级就越低，这样人为地在土著之间分个三六九等，就可以让他们在短时间内无法团结起来与统治者进行对抗。