为了适应局势，朱训樘大刀阔斧进行改革。
首先，建立大都督府，掌管全国军事，下设五个卫所，分别为中，前，后，左，右，每卫大概一万人，设指挥使一人，正二品。
其中一卫又分十个千户所，每所一千人。
十个千户所分为上中下三等，为了便于区分，颜色分别为红，暗绿，灰三种，分别对应明兵，夏兵，和商兵。每户下辖十个百户所。
一卫明兵一千人，夏兵三千五百人，商兵五千五百人，商兵千户均由明兵或者夏兵担任，夏兵千户由明兵担任。
所有的军政，由卫下达于千户所，千户督百户，百户下达总旗、小旗，大小联比以成军。
中卫掌管京城及夏宫，指挥使由朱小五担任。
不过为了防止小人作乱，故中卫中除大明千户所可以入京任职，其他九个户所不得入京，只能驻扎城外。
朱训樘还对宋爱明，郭威，齐俊林三位原禁军统领做了调整。
宋爱明“忠心爱国”，故封为左都督，正一品，协助皇帝统领全国军事，郭威任左卫所指挥使，正二品，齐俊林任右卫所指挥使，正二品。
各地要害之地设置都指挥使司，弥补不足，都指挥使司与卫不同，人数大多为几百到上千左右，大多数由原先各地驻扎的禁军组成，保证国内的稳定。
到天命元年四月份，军事改革基本完成，形成了五卫，十三个都指挥使司格局，名额人数为七万人。
当然，有的地方空有名额，却无人。
有的地方明兵太少，只能等大明人继续增多之后才能补充。
大明元年六月份，大明动员前，后，左三个卫所奔赴东方前线，号称五万大军，任郭威为破虏帅，浩浩****地进军，其中共有一百零三个部落首领亲自参加，一场轰轰烈烈的“入关运动”开始了！
夏宫中，宋念雪脸色寒青，双眸含着泪花，愤怒地看着宋爱明。