可惜的是，卫青与霍去病相继离世，卫太子的地位也因为其秉性与汉武帝屡屡相悖而受到厌恶。
致使奸佞小人江充等人可以成功离间太子和皇帝的父子关系，最后酿成了巫蛊之祸。
太子刘据为了避免无辜被馋毙，就开始寻求母后卫子夫的支持，企图起兵自卫。
据《汉书》记载：“太子使舍人无且持节夜入未央宫殿长秋门，因长御倚华具白皇后，发中厩车载射士，出武库兵，发长乐宫卫，告令百官曰江充反。”
当时的汉武帝在甘泉宫避暑，并不在内宫。
所以刘据首先就去寻求皇后的支持，长乐宫正是皇后的所在，而当时的武库兵器也一定要有皇后的凤印才能够发动，没错就是皇后的凤印，可见权利有多大，都能调兵了。
而这次发动武装力量也将太子刘据和卫皇后彻底葬送。
在动乱被平息后，太子刘据一家被杀。
汉武帝也下令“诏遣宗正刘长乐、执金吾刘敢奉策收皇后玺绶，自杀。”
汉武帝和卫皇后的爱情故事至此以悲剧而收场，卫子夫进入宫廷之前是庶人的身份，结束生命时也是庶人的身份。
这样的结局就是因为她以皇后的身份授权给了太子刘据起兵，卷入了这场汉室风波之中。
而在后来汉武帝思念卫太子，建立了思子宫和归来望思之台。
但对于卫皇后，汉武帝却从来也没有表现出一丝怀念之情，也许汉武帝到最后也没有原谅卫皇后的罪行。
由此可见，汉朝皇后手中掌握的权力非常强劲，甚至可以左右政局的走向。
汉代皇后的手中握有玺印，这就是权力的象征。汉代时期还是一个传统社会，对于玺印等一系列特殊政治物品有天生的尊重心态，诏书中只有加盖了皇帝的玉玺才会成为旨意。
同样，皇后的玺印也可以发号施令，行使核心政权。而且汉代的律法中并没有规定皇后与太子等皇帝至亲的权力范围，这就意味着这种权力既可以趋近于零，也可以无限大。