澎湖距离台湾约莫50海里，是保卫台湾防止鞑子入侵明郑的战略前哨，自古以来军事地位极其重要，素有“无澎湖则无台湾”的说法，永历十五年郑成功亲自率军从厦门出发东征台湾，抵达澎湖海域遭遇暴风袭击，被迫临时驻扎澎湖抛锚避风，当时荷兰殖民者由于兵力匮乏没有在澎湖驻军防卫，坐视明郑军队安然休整后从容不迫通过鹿耳门进击台湾，仓猝应战惨败被迫投降，识者无不认为荷军自失地利，是导致决战失败被迫灰溜溜退出台湾的重要因素。
郑成功军事眼光极为高明，自然不会重蹈荷兰殖民者的复辙，收复台湾坐镇东宁府后立即下令骁将刘国轩率领明郑水师驻扎澎湖，花费二十多年苦心经营，把澎湖建造成为抵挡鞑子水师入侵台湾的战略要地，郑经袭位后特地设置澎湖安抚司，正式成为明郑一府两州三司之一，历代延平郡王为确保东宁府安全对保卫澎湖都极为上心，明郑户官每年都要拨出大批经费在澎湖诸岛添城筑垒，先后在牛头山、西屿头等邻近岛屿设置坚固炮台，派遣哨船快艇前往海峡中线往来巡逻，防止鞑子水师突袭登陆。
明郑水师的大本营位于澎湖港，是由多座岛屿包围的深水良港，全盛时期驻有主力战舰数百艘，光是每日运往澎湖港的给养就高达数吨，从早到晚船只进出港口络绎不绝，鞑子水师战舰无不退避三舍，如今明郑水师被冯锡范刻意打压士气低落，不少水师官兵感觉前途无望，偷偷潜往漳州厦门投降施琅，驻在港口的主力战舰已不足百艘，设备陈旧经费紧张，被施琅指挥的鞑子水师战舰迫得再也不敢越过海峡中线，在战略上处于防守态势。
饶是如此明郑水师将领对抵挡鞑子水师入侵还是信心十足，施琅虽然绰号海霹雳精通海战，然而论起军功还是不如明郑军神刘国轩，施琅降清初期曾与刘国轩数次海上交锋，屡战屡败狼狈溃逃，只要刘国轩依旧掌舵明郑水师，水师主战派将领对击败鞑子水师入侵就有充足信心。