长崎的著名土特产也有很多。
玳瑁手工艺品是长崎最具有代表性的手工艺品，其中女性饰品尤为出众，如耳环、项链、手镯、发卡等，加工繁复、色泽透明为上品。
玻璃制品碧多萝也相当受欢迎，鲜艳而又清透的色彩，加上纤细又光滑的触感，是做工细致、精巧优美的工艺品。“碧多萝”源于佛郎机语“VIDRO"。
因为玻璃的制取温度要1200-1600摄氏度，而且透明玻璃烧制有一定工艺难度，所以此时扶桑的玻璃都来自兰国商馆，扶桑的手工业者购买玻璃后再进行二次加工——添加色彩和重新塑形，有名的玻璃制品有江户的江户切子、长崎的碧多萝。
“云仙烧”是用“云仙地狱”（火山）的土石上釉烧制而成的，具有古朴的乡土气息。
古贺玩偶类似于中国的泥人，造型是人物或动物。
长崎出产的风筝多种多样，作工精良，尤其是壹岐的"鬼脸风筝"，色彩艳丽、造型独特，远近知名。
三川内陶瓷器和波佐见陶瓷器具有悠久的历史。三川内陶瓷器的特点之一是用透雕的工艺将产品制作得精细优美，具有很强的装饰效果。另外，独特的纯白和纤细优美的蓝釉花纹也别具特色。而波佐见陶瓷器主要是用于餐饮的器具，色彩淡雅，制作精美。这些陶瓷是献给将军等大人的贡品。
长崎有漫长的海岸线，出产珊瑚和珍珠，经过加工的珊瑚和珍珠华贵精美，也是此时的珍品。
直秀苟了两天，没发现盯梢和可疑人物，感觉安全了，这才带着两个学生去取书。德弗里斯医生的弟子叫中村田一，开了一家兰医诊所，据说在当地名气不小，直秀顺利地见到了他，交谈之后私下找机会一个人的时候也顺利地拿到了书，鼓鼓的一个包裹。因为以后还要通过中村来和德弗里斯保持联系，所以直秀的谢礼颇为贵重，包括一把制作精美和扇和两册最近发行的兰学医书。