脱脱在实行变钞的同时，决心治理黄河。
他的这个做法，自然是为国为民的做法，却哪里知道，是加速元朝灭亡的开始。
元朝的水患，早在至正八年二月时，元廷就命贾鲁为行都水监使，专治河患。
贾鲁经过实地考察、测量地形、绘制地图，提出二策："其一，议修筑北堤，以制横溃，则用工省；其二，议疏塞并举，挽河东行，使复故道，其功数倍"。
但他的建议未被采纳。
如果元廷及时采纳贾鲁的建议，那么，元朝还有挽救的机会，因为，这时的元朝，还没有病入膏亡。
至正九年，脱脱复相后，专门召开治河讨论会，贾鲁以都漕运使身份再次提出自己的治河主张，并进一步强调"必疏南河，塞北河，修复故道。役不大兴，害不能已。"
脱脱当机立断，取其后策，并不顾工部尚书成遵等抗争，坚定地说："事有难为，犹疾有难治，自古河患即难治之疾也，今我必欲去其疾！"
脱脱明知"此疾难治"，也明知要冒巨大风险，还是坚决地"欲去其疾"；他深知越是不治，越是难治，越难治，饥民、流民问题越严重。
脱脱是把治河当作制止"盗贼滋蔓"的重要手段来加以认识的。
可惜的是，他的认识虽及时，做法也果断，可惜，元朝气数将尽，脱脱再英明，也挽救不到元朝。
至正十一年四月初四日，妥欢贴睦尔正式批准治河，下诏中外，命贾鲁为工部尚书、总治河防使，发汴梁、大名十三路民，十五万人，庐州等地戍军十八翼二万人供役。
四月二十二日开工，七月完成疏凿工程，八月二十九日放水入故道，九月舟楫通行，并开始堵口工程，十一月十一日，木土工毕，诸埽堵堤建成。
整个工程计190天。