后金崛起后，辽东的守卫，成了大明的第一消耗，每年约需银四百余万两！
朱翊钧为了应付这笔庞大的军费，自万历四十六年九月起，先后三次下令加派全国田赋，时称“辽饷”。
明末三饷，也就是辽饷、剿饷、练饷，这三饷的加派，不但没有消灭贼寇，反而激起了全国人民的强烈不满，纷纷投入反对明朝的起义洪流中。
朱翊钧面对这样的局势，心情极为低落，终日愁眉不展。
这样一来，朱翊钧就更加沉溺酒色无节了，他外有国事困扰，身子又被酒色虚淘，哪里还承受得起？终于病重不起。
万历四十八年，公元1620年七月二十一日，朱翊钧在弘德殿咽下了最后一口气，终年五十八岁。
二十二日，朝廷发丧，二十三日颁布遗诏，命皇太子朱常洛嗣位。
《明史》对宋神宗朱翊钧的评价是：神宗冲龄践阼，江陵秉政，综核名实，国势几于富强。继乃因循牵制，晏处深宫，纲纪废弛，君臣否隔。于是，小人好权趋利者驰骛追逐，与名节之士为仇雠，门户纷然角立。在廷正类无深识远虑以折其机牙，而不胜忿激，交相攻讦。以致人主蓄疑，贤奸杂用，溃败决裂，不可振救。故论者谓明之亡，实亡于神宗，岂不谅欤。”
朱翊钧的前十年，因为有张居正在，所以，这是欣欣向荣的十年；第二个十年，是朱翊钧自己亲政的十年，他为了超越张居正，发愤图强，确实做得很好；可是，后面近三十年，他开始怠政，几乎不上朝，虽然，权力仍然抓在手里，但是，对国家的管理，可就没那么到位了！尤其是面对后金的崛起，他一点办法也没有；另外，三大饷，加重的百姓的负担，为后来农民的起义，埋下了伏笔。所以史书上说，明之亡，实亡于神宗！
这话不是没有道理的！