而且国王也听说了阿维森纳是一位非常非常博学的人，故此就任命他为宰相。但是由于阿维森纳正是博学深知这个世界中的一切，乃至明白所有的人心，故此他为人刚正不阿，完全不擅长虚假的应酬，因此得罪了朝中很多的权贵，经常受到排挤。
更是这些权贵们心术不正，他们都是为了个人的利益，或者我们可以说是为了他们自己的自私，乃至他们穷奢极欲、荒**无度的生活。明显阿维森纳和他们不是一伙人，这还影响他们，故此这些权贵们就经常在国王面前各种诬陷阿维森纳，希望将此人除去，以免长期影响他们的自私。
但是国王一般都不信这些权贵们的话语，直到有一次国家发生了动乱，王室的卫队们诬陷阿维森纳他在家中暗藏奸党，突然就闯入了阿维森纳的家中，将他家中的所有物品全部洗劫一空。也辛好阿维森纳从后门逃走，这才躲过了一劫，不然就会被王室的卫队们当场杀害。
最终国王死后，国王的儿子们为了争夺王权，这就展开了非常残忍亦血腥暴力的战争，整个王室内部乱成一团，天天都在死人，各种各样乃至花样的死。然后有人认为这个时候的阿维森纳是个威胁，所以就散布谣言，说阿维森纳不信真主，并且还散布邪教，阿维森纳因此入狱。直到经过很长时间的王室内部斗争，最终新国王登基之后，这才查明了一切事情，也知道了阿维森纳是被冤枉的，故此阿维森纳才被释放出来。释放出来后的阿维森纳被任命为国王的随从医官和科学顾问。
这个时候的阿维森纳为了探索医学的奥秘，还想解除人民的痛苦，阿维森纳他就笔耕不辍。他先后写成《医典》、《活着的人们，死亡之子》、《指导大全》、《心脏病的治疗》等等等等，共计有高达几十种作品。