此时的察合台汗国为了掠夺财富和占有农场，这就与元朝的伊儿汗国发生了旷日持久的战争，整个过程非常的血腥残忍，但是战争一直以来都是这样的，赢了平民们也可以得到一些利益，输了，绝对就是苦不堪言，而且在这一战争的过程中，大量征收平民们的资源和粮食，乃至让平民们上战场，这就让大量的平民们死亡，再加上食不果腹，衣不遮体，总之很是凄惨，但要打赢了，平民们的生活确实能得到一定程度上的改善，不过更多的资源是被高层拿走而已。
可是这次察合台汗国是打输了，所以后果可想而知。最后到了一三一四年，怯伯成为了察合台汗，因为此时整个察合台汗国内部因为打仗导致严重的虚弱，平民们的生活都不好过，故此怯伯主动与元朝恢复了友好关系，从此两国使节也是来往不断。怯伯这个时候还把都城迁到了撒马尔罕，怯伯他是比较提倡农业发展的，因为前些年的打仗导致粮食非常紧缺，直到现在国内的一些平民们都要被饿死，所以怯伯这个时候也就实施了改革，也就是实施定居的模式，然后进行农业发展。
但是怯伯的哥哥也先不花汗，则坚持要过游牧民族的传统，反对这种定居的农业发展。可这是哥哥和弟弟之间的争霸，是亲人，所以他们两个人之间并没有发生战争，而是将察合台汗国分成了东、西两个部分。东部以阿力麻里为中心，包括喀什、吐鲁番等地区。西部则是以撒马尔罕为中心，统治着中亚地区。
东察合台汗国是从一三四八年建国，到了一五一四年被叶尔姜汗国取代，立国一百六十六年，西察合台汗国在一三七零年被帖木尔汗国所灭。我们从这里也不难看出，其实他们自己内部也在发生巨大的争斗，或许这就是我们今天现代人所谓的人心吧？