毕达哥拉斯学派不仅认为数是万物的本原，而且还认为对立也是万物的本原。
一 和谐来自对立
亚里士多德记载，毕达哥拉斯学派中的另一些人说有十对本原：“有限—无限、奇—偶、一—多、右—左、雄—雌、静—动、直—曲、明—暗、善—恶、正方—长方”，并明确规定它们是相反的东西；“‘相反’是事物的本原”[23]。
根据这一派的见解，作为“相反”的“对立”导致和谐。公元1世纪时期毕达哥拉斯学派哲学家和数学家尼各马科在他的《算术引论》中，就记载下菲罗劳斯的这种观点：
和谐总是来自对立，因为和谐是不同因素的统一，以及是相反的因素的协调。[24]
尼各马科又不指名提到另一些早期毕达哥拉斯学派的成员，也有相类似的观点：
一般地说，和谐起于差异的对立，因为“和谐是杂多的统一，不协调因素的协调”（引斐安的话），毕达哥拉斯学派（柏拉图往往沿用他们的学说）也说：音乐是对立因素的和谐的统一，把杂多导致统一，把不协调导致协调。[25]
毕达哥拉斯学派虽然不是最早论述有关对立问题的哲学家，但是认为万物的本原是一对对的对立的，却是从他们开始的，并进而认为由于一对对的对立的因素，或相反的因素导致和谐统一、协调。表明他们的美学思想中含有辩证法的因素。他们正是以这种辩证的观点来探讨从个人到国家乃至整个宇宙的和谐。
公元2世纪时的柏拉图主义者士麦拿的忒昂（Theon of Smyrna）在他那部专门讨论算术、音乐和谐理论以及天文学的著作中就谈到，毕达哥拉斯学派称音乐是对立的和谐，是对立事物的统一和相互斗争因素的调和。因为，他们不仅要求节奏和旋律，而且要求宇宙的整个系统都要依赖音乐，而音乐的目标就是统一与和谐。神使相互斗争的因素达到和谐。实际上，这正是神运用音乐和医学的最大的目的，即使那些敌对的事物达到和解。正像毕达哥拉斯学派所说的那样，音乐是自然中诸多事物统一的基础，是世界上最好事物的基础。作为一个法则，音乐在宇宙中采用了和谐的形态，在国家中采用了合乎法律的政府形式，在家庭生活中采用了通情达理的方式。它带来了一致与统一。因此，体现和谐与统一的音乐，具有无比巨大的重要作用：