与电子书美好的远景相比，当前我国电子书的发展状况仍然不是非常理想，还有很大的提升空间。阻碍电子书发展的主要问题如下。
（一）电子书商业运作模式
相比于国外亚马逊已经成熟的电子书运作模式，我国在建立基于我国国情的电子书商业模式方面还有很大的探索空间。很多电子书出版商看好这块“大蛋糕”，但研究和创新不够，没有深入地把握读者的消费心理和需求，缺乏对电子书开发到销售各环节关键的把握。电子书的价格也高下不一，缺乏相对统一的标准。同时，在技术的投入方面，开发的产品还不够优质，也缺乏对数字阅读的深刻理解，这些都不利于理想商业运作模式的打造。
（二）电子书格式标准
从目前电子书市场上图书格式来看，种类繁多，不同的技术公司采用自己的格式规范，如超星的PDG，清华同方的CAJ，方正的CEB、CHM、DPUB，Adobe的PDF等。这种做法的出发点和动机不难理解：企业在没有统一格式要求的状况下，为了保护自身利益，防止盗版和非法复制，并借此捍卫自身地位，扩大自身影响。然而，却给用户增添了使用上的困难，各阅读器互不兼容，面对不同的阅读器需要不断适用和学习操作方法，书籍内容相互转换和整合困难。对出版商而言，重复地开发建设也浪费了大量的成本和资源，降低了文化传播的效率和效益。
（三）电子书知识版权保护
数字化内容易于复制、传播的特点，体现出技术的两面性：一方面是电子书发行快捷，传播效率高；另一方面其复制的成本几乎为零，容易被盗版而使出版商、作者利益蒙受损失，不利于电子书的良性发展。对电子书知识加强版权保护已成为当务之急，需要强化立法、执法加以保障，同时提升相关技术，通过加密等方式使盗版难度加大、成本提高。