高加美拉在古亚述首都阿淑尔附近，大流士三世在这里集结了号称百万大军（实际上不过八万左右，其中包括两百辆配备有弯刀以对付方阵的战车和十八头大象），准备和亚历山大再次进行会战。为了自己的战车和骑兵能发挥威力，大流士三世命令把高低不平的地方铲平。据阿里安的记载，会战时双方军队的部署情况如下：
大流士的军队左翼是巴克特里亚骑兵，和他们在一起的有达海人、阿拉科提亚人。和他们并排的部队是波斯骑兵混编部队。波斯人后面是苏西亚人，最后是卡杜西人……右翼是叙利亚、美索不达米亚部队、还有米底人。在他们后面是帕提亚人、塞种部落，然后是塔普里亚人、赫卡里亚人，再往后是阿尔巴尼亚人、塞克西尼亚人……在大流士国王全军中央，有亲王、波斯人、‘苹果手’（按：波斯国王的侍从，因其长矛尾部刻有苹果状物而得名）、印度人、号称‘移民’的卡里亚人、马尔吉安那弓箭兵。攸可西亚人、巴比伦人、红海各部族人及西塔刻尼亚人组成军队的纵深。在左翼之前，正对着亚历山大右翼的地方部署有西徐亚骑兵、约1000名巴克特里亚人和100辆刀轮战车。在大流士王家中队旁边还部署了象队和50辆战车。右翼的前方部署了亚美尼亚、卡帕多细亚骑兵及50辆刀轮战车。希腊雇佣兵部署在大流士身边的波斯人两侧，他们部署在马其顿方阵对面，他们是唯一能够对付这个方阵的部队。亚历山大军队部署如下：右翼是重装骑兵团。左翼马其顿军队有亚历山大之子克拉特拉团，他同时又是左翼所有步兵的指挥官。和该团并排的有拉里卡斯之子埃里吉亚指挥的盟军骑兵。左翼和他们并排的还有迈尼劳斯之子菲利普指挥的帖撒利亚骑兵。整个左翼由菲罗塔斯之子帕纽曼指挥。他身边有帖撒利亚骑兵，他们是帖撒利亚骑兵的精华和多数。