制度的问题要通过制度来解决，我国农村土地流转中的农民土地权益保护问题还是要从制度的角度入手。农村土地制度的创新和完善是农民土地权益保护的根本，农民土地权益保护是改革和发展的主线。我国农村土地流转中农民土地权益保护法律制度的完善亦受城市化发展的影响并应借鉴国外的一些经验。我国土地流转中农民土地权益保护法律制度完善的基本原则是坚持农村集体土地所有制，要义是保证流转中农民和土地的自由与平等，目标是实现土地资源配置的效率和秩序。针对现实中存在的损害农民土地权益之因素，基于上述价值目标的选择，我们在完善法律制度的基础上，也要根据不同土地类型所需选择不同的土地流转模式：承包地经营权流转要实现规模经营；集体经营性建设用地与国有土地同权同价；宅基地使用权根据使用情况区别流转；对小产权房则分类进行清理。对法律制度的完善以及不同类型土地流转模式的选择，既实现了土地流转的有序性，又保障了农民土地权益在土地流转中的落实，更为重要的是，制度的完善和模式的合理选择对于我国耕地保护亦具有极其重要的现实意义。
[1] 范健、张中秋、杨春福：《法理学——法的历史、理论与运行》，169页，南京，南京大学出版社，1995。
[2] 张文显：《法理学》，252页，北京，高等教育出版社、北京大学出版社，2011。
[3] 谢鹏程：《基本法律价值》，18页，济南，山东人民出版社，2000。
[4] [英]梅因：《古代法》，沈景一译，96～97页，北京，商务印书馆，1959。
[5] 林道海：《论法的自由价值》，载《政治与法律》，2006（5）。
[6] [法]皮埃尔·勒鲁：《论平等》，王允道译，20页，北京，商务印书馆，2009。