无形资产评估方法直接关系到评估结果，我国无形资产评估实践中，往往由于不能运用科学的方法，造成较大的误差，因此高校要深入研究各类无形资产的评估方法，借鉴国外先进经验，结合我国评估工作的具体实践对评估方法加以创新。现行的无形资产评估方法主要有市场价值法、收益法和成本法三种。
第一，市场价值法。这种方法根据市场交易确定无形资产的价值，适用于专利、商标和版权等，一般是根据交易双方达成的协定以收入的百分比计算上述无形资产的许可使用费。这种方法存在的主要问题是：大多数无形资产并不具有市场价格，有些无形资产是独一无二的，难以确定交易价格；无形资产一般与其他资产一起交易，很难单独分离其价值。
第二，收益法。这种方法是根据无形资产的经济利益或未来现金流量的现值计算无形资产价值的，如商誉、特许代理等。这种方法的关键是确定适当的折现率或资本化率。这种方法存在难以分离某种无形资产经济收益的问题。此外，当某种技术尚处于早期开发阶段时，其无形资产可能不存在经济收益，因此不能用这种方法进行计算。
第三，成本法。这种方法是计算替代或重建某类无形资产所需的成本，适用于那些能被替代的无形资产的价值计算，也可估算因无形资产使生产成本下降、原材料消耗减少或价格降低、浪费减少和更有效利用设备等所带来的经济收益，从而评估出这部分无形资产的价值。但由于受某种无形资产能否获得替代技术或开发替代技术的能力以及产品生命周期等因素的影响，无形资产的经济收益很难被确定，这使得此法在应用上受到限制。