天台宗禅教并重，其教号为大乘圆教，特重《法华》，故又号法华宗。其禅法事实上仍是以五门禅法为主，兼具法华三昧等念佛法门，故其禅教源流不同，也始终未能融为一体。智者大师所述三种止观等禅法皆属五门禅法与念佛三昧，后世亦未有所突破。对于这一事实，天台宗后世也是承认的。元怀则《天台传佛心印记》解释此事云，以六识心为所观之境正合近要，观缘九识真心如用藕丝悬山，无有效验。
天台宗义以“性具”为本，一念三千，无所不包，善恶染净诸法，俱在此一念心中。禅宗言自性具足，强调的是自心具足一切净法，而天台宗则强调自心同样具足染法，立说趋于极端。为了说明成佛的可能性，涅槃佛性系经典说阐提不断性善，一切众生皆有佛性，都有见性成佛的可能，诸多大乘经典都强调世间与涅槃、众生与佛之间并无不可逾越的距离，这都是为了使众生相信自己身心之中有佛性种子，具有解脱成佛的可能。而台家却从另一角度说明众生与佛之间无距离，不论般若类还是涅槃类大乘经典都强调众生与佛无差别，将众生引向佛，台家却独具新见，反过来说佛不断性恶，佛与众生无别，将佛引向众生。或谓佛唯具性恶，不起修恶，故有恶性而无恶行，但即如此，也难免走向歧途。言众生是佛，阐提不断性善，是为引导众生自信自悟、自修自度，既具畅明大智，又摄无缘大悲，而言佛是众生，佛不断性恶，除了在理论上说明佛具足一切的周遍性之外，又有什么实际意义呢？台家本义也许不是令诸佛下降为众生，只是为了说明性具之理，说明诸佛心性圆满具足、无欠无缺，且远离善恶、染净分别二见，虽具性恶而自无染，自由自在，在染不污，神通游戏，无量妙用。但如此立说总会有损佛法，在理论上未必称得上突破，在实践上则更为有害。如此只强调诸佛的普遍性而不顾其殊胜性，眼界已然有偏，虽然博得一时新奇之名，又如何能真正立足呢！