仅用半年时间，清军就征服了朝鲜，占领了皮岛。清军在此战中，缴获了大量的财物、人口、牲畜、军械。战中和战后，所有参战的亲王、贝勒、大臣和贝子们，通过分红和私捞，弄得沟满槽平。
众人在家里忘乎所以地数点钱财，皇太极在宫中专心致志地查黑账。
在皇太极称帝之后，他并没有对政府内的臣子持乐观、信任的态度，始终坚持边观察边使用、边使用边观察的策略。他深知，他手下这些亲王、贝勒和大臣，虽然表面上对他尊敬无比，但每个人心里都有小九九，目无法纪、有意无意对抗法令的大有人在。要让这些人心服口服，对他们在政治、经济上进行一两次降职或罚款，是很难奏效的。
皇太极与这些人的斗争，虽然是长期的、持久的，但他不会错过任何一次打压他们的机会。只有把他们全部整服、整老实，整倒，甚至整死，他的皇帝宝座，才会坐得踏实。
皇太极把心腹交上来的账本认真地审查一遍，发现在征朝过程中，自礼亲王代善以下，包括他的儿子、弟弟、侄子，共64人有各种不同程度的违法乱纪行为。这些行为，都是他在出征前特意强调过的。如，私自携带无甲之人冒名顶替从军；纵容属下抢掠、强娶降民妇女；不听从军令擅自行动；私自藏匿缴获的战利品；战斗中畏缩不前致使士兵无谓伤亡等。
这次，皇太极让刑部负责人济尔哈朗留守沈阳，就是担心他也会像这些人一样，在战场上习惯性地犯老毛病。现在，济尔哈朗一身清白，皇太极可以命他理直气壮地充当打手。
皇太极把朝鲜、皮岛后续事宜处理完毕，便在一次会议上提及此事。
皇太极说：“承上天保佑，我们这次出兵朝鲜，从崇德元年十二月到现在，历时5个月，在各位臣工共同努力下，征服朝鲜，占领皮岛，彻底清除掉我大清后方隐患，从而使我们可以专心攻明。