大脑是一块重约1.4千克的灰质块，也是现代科学至今仍未解决的谜团。最初，大脑似乎是为了控制身体的运动而创造出来的。海鞘在幼虫的时候有大脑，可以四处移动；当它们在一个地方开始长期生活的时候，它们就会吃掉自己的大脑，因为它们现在不用动了，就不需要大脑了。就这样，大脑本来是用来控制运动的神经束，在人类的身上，它变成了一个通用程序，拥有超乎想象的能力。大脑这个消耗身体20%能量的超级计算机使人类成为地球的主宰者。我们到现在为止所说的也都是围绕着大脑发生的事情。
就像智人经历了从鱼类、两栖动物、爬行动物、哺乳动物进化到灵长类动物一样，人类的大脑也经历了多个阶段的进化。20世纪70年代，一位名为保罗·麦克莱恩(Paul D. MacLean)的神经科学家将人脑的进化划分为三个阶段，并称之为“脑的三位一体理论”(三重脑理论)。也就是说，我们的大脑里面有哺乳动物的大脑、爬行动物的大脑和人类的大脑，这些大脑有各自的功能。这种三重脑理论因 卡尔·萨根(Carl Sagan)在《伊甸园之龙》中的提及而被大众所了解。
在最里层的是爬行动物脑，它负责基本的呼吸、循环和运动。由于它承担着基本的生命活动，所以会在没有理性干预的情况下立即做出反应。当有一个长长的、蠕动的东西从眼前经过时，大吃一惊的爬行动物大脑会下达“是蛇，快躲开”的命令。
中间的一层是哺乳动物脑。它负责基本的情感和母爱等本能，也负责一段时间的学习和记忆。你在学校或工作单位被孤立时，甚至会选择寻短见，就是因为这一部分的警告灯开启了。它是帮助人们群居，进行社会生活的大脑。
最外面一层也是形成最晚的大脑，就是人类脑。它可以进行抽象复杂的思考，也可以进行“我是谁”等高层次的思考。但与最里层的大脑相比，它的反应较慢，需要集中注意力才能正常工作。