天启四年的正月里，并不太平。
先是杭州兵变，有诸生家张灯，不慎火起，延烧房屋，九营兵卒乘乱而起，抆钱塘门外更楼十座。
当时有杨把总，约束营兵勿予乱，被各兵捆绑还营，悬之高竿，欲以弓箭射之，两游击好言抚慰乃定，最后杨把总被革职。
再就是朝廷中，魏忠贤的野心越来越大，汪文言下狱，东厂太监魏忠贤本想借机罗织罪名，打击外廷。但刘侨结案很快，忠贤大怒，以私人许显纯代刘侨掌镇抚司，正人日危。
同样从正月开始，先是扬州发生六级地震。
南直应天府苏、松、凤、泗、淮、扬、滁州等处同日地震。扬州倒卸城垣三百八十余垛，城铺二十余处。
再是，京师滦州地震。
从正月开始，蓟州、永平、山海关等地屡震，震坏城郭、庐舍无算。
至是，滦州大震，坏庐舍无数，地裂涌水异物，乐亭旧铺庄，地裂涌黑水，高尺余。
迁安声如巨雷，塌坏城垣民舍无数，卢龙震倒官民房舍甚多，京城内宫殿动摇有声，铜缸之水腾波震**。
这次地震连续时间长，有的一日二、三震，如东安，辰巳时地震，至申时又震，从乾起有声。
等到二月初，京师又震三次。
大城地累震，屋瓦动摇，夜不敢寝，多有露宿者。东光地大震物皆摇动。
昌黎、新安、真定府、蓟州、遵化、玉田、河间府、保定府、天津三卫，以东山东临邑、德平、海丰、武定州等二十余州县皆震。
而在因小冰河地震频发的同时，海上也不太平。
先是荷兰人既而复来，筑城澎湖，进犯厦门，为明军所败，乃又求和。再许其毁城远徙，而又复筑如故。后又停泊风樻仔，出没沿海地区，又要求互市。
在荷兰人的背后，是大海寇李旦帮助。
同年，郑芝龙被荷兰东印度公司接纳为通事，乘船离开日本前往台湾，后加入海寇李旦。