两日后，刘琦离开了雒阳，再次转兵奔向了河南的战场。
袁绍和曹操还在那里与己方对峙，虽然有黄忠，吕布，张辽，高顺，太史慈，赵云，甘宁等名将坐镇，但自己不在阵前指挥，刘琦心中多少还是有些不安，毕竟事关重大，而且前线的战场还有袁绍和曹操这样的巨头在。
雒阳这边，刘琦在离开之前，将所有的事情交付给了尚书台处理。
首先，就是定罪。
所有参与这次事件的公卿士族，全部都定义成谋反。
而为首者则是杨彪，堂溪成，吴硕，吴修，耿纪，赵岐这些人。
罪状的直接证据就是他们的供词。
而证人，就是被他们胁迫的扶风马氏长者，大儒马融之孙，马日磾。
马日磾是被这些人胁迫，不得已而与他们走到一起，不过马日磾知道很多关于他们密谋计划，如今为了清理罪，已经全盘脱出。
包括这些人是受到袁绍的贿赂与许诺，想要借改革的事情抹黑当朝天子，并在推翻天子新政之后，拥袁绍入雒，并助袁绍篡汉登基，结束大汉四百年国运等等。
而且，包括起事时间，编造的理由，袁绍登基之后许诺给他们的官职和族中的利益等等……就连他们给袁绍制定的年号和国号都供出来了，说的真是有鼻子有眼的。
针对这样的局势，当朝天子宽宏，最终还是赦免了不得已而参与其中的马日磾。
朝廷方面下令，马日磾的供词和反贼们的供词将在各郡传递，将雒阳城中反叛的一众公卿的罪名证实。
而随同那些公卿造反门客，死士，家奴全都被判处了斩刑。
刘琦走后，整个雒阳陷入了一片腥风血雨之中，被杀的公卿加上他们的附庸在雒阳全部被判处斩刑。
万余人在雒阳被杀，自然是天下震动。
与此同时，以长安为中心，文聘率军开始在关中和司隶境内，捉拿反叛公卿的三族。