顺准两军在伊犁河谷连续激战五天四夜之久，最终以准军全线溃败，逃亡葱岭以西告终。
至此大顺军彻底实现了远征天山、直抵伊犁的战略目标，实现了深入虎穴、犁廷捣巢的任务。
当这一消息经由蒙古牧民传到漠北的时候，僧格浑台吉闻讯惊愕病倒，原本臣服于准噶尔人的喀尔喀诸部，见此情形，也在当地大喇嘛的带领下选择了向顺朝投降。
僧格浑台吉的手下虽然还有三万骑的兵力，但是由于喀尔喀盟友的叛变，再加上天山老家的丧失，全军上下士气低落，部众星散，不复为伍，未经一战，便有上万部众相继逃散。
安东大都督府所辖的东军也适时地抵达战场，给了僧格浑台吉最后的致命一击。
安东军在叛降喀尔喀诸部的协助下，**，抵达和林，将准噶尔余众击溃，生擒了僧格浑台吉，将其押送回京，同多尔衮一样发配山东修黄河去了。
大顺军**平准噶尔汗国的一役，用兵行军快如闪电，刘芳亮的大胆挺进，为收获最后的全胜之功打下了定锤之音。
自此西域三路全部重归中国版图，朝廷得到战胜之讯后，立刻听从了刘芳亮的建议，任命李懋亨为安西大都督府大都督。
对于西域的东疆、西疆、南疆三个边疆地区，则按照此前在黑水营战死的果毅将军吕泽遗策，采取了分而治之的手法。
东疆地区，即东天山南北的哈密、吐鲁番和巴里坤等地。这一地区在东天山以北是游牧地区，东天山以南的哈密、吐鲁番是农耕地区。
大顺在这一带直接设置了郡县州府，进行流官管辖。过去统治哈密一带的回部土司、蒙古游牧部落，其牧民被迁徙到青海放牧，农民则留居本地，由大顺委派的官吏实行编户齐民的直接管理。
为了保障安定，李来亨下令改沙州为敦煌府，将哈密府、敦煌府、瓜州、安定州都编入甘肃省的建制内，并将甘肃省的省会由兰州迁至更靠西面的甘州（即张掖）。