朱由校不得不回京的原因很简单，因为北京城的那位魏公公跟东林党人干上了，而且这次事情闹得比较大，魏公公不但把东林党的一些人给抓了，而且还给杀掉了，其中就包括杨涟、左光斗、魏大中、周朝瑞、袁化中、顾大章等在内的一众东林党的骨干。
当然了，魏公公是指使东厂的人抓的，至于锦衣卫他暂时还插不上手，所以虽然他已经下令不要将这个消息告诉朱由校，但很显然他还没做到一手遮天的地步。
朱由校虽然文化水平较低，平日里也不大管事，但他也知道这事的严重性。在他刚当皇帝的时候，大明的朝堂正是党政激烈的时候，那时候的朝堂上党派可谓五花八门。
众所周知，华夏人喜欢抱团取暖，也比较喜欢用地域来划分界限团体，比如一个官员到了京城，人生地不熟的他首先要做的第一件事就是找老乡拜码头。山西的找山西的，浙江的找浙江的，找到之后大家一看，诶呀大家都是老乡啊，以后可要相互关照啊，于是乎党派就这么来了。
大明晚期的党派大致分为齐、楚、浙以及东林党，在这些党派里齐、楚、浙三党由于都是纯粹的地域性质的党派，所以势力比较弱，而东林党就比较牛逼了，这个自诩代表老百姓利益的党派成天高喊着为天地立心，为生民立命，为往圣继绝学，为万世开太平，他们用这些口号很是忽悠了一批读书人。
当然了，口号毕竟是口号。东林党人除了为江南地区的地主阶层充当代言人和保护伞之外他们最擅长的就是跟除了自己党派以外的人斗。他们斗天斗地斗，当然也缺不了齐、楚、浙这三党。双方的矛盾越来越激烈，什么争国本、妖书案、梃击案，只要有机会双方就会下死手打击对方，从万历十几年开始双方就开始闹，可谓是历史悠久。