一六四零年，巴图尔通过战争占领了七河流域地区，迫使大多数部落氏族向他臣服。
巴图尔还曾连续两次击退沙俄的侵略，迫使沙俄承认了准噶尔汗国，遏制了沙俄染指新疆的企图。
准格尔汗国四处征服其他部族，一六四二年出兵南疆，攻灭叶尔羌汗国，把广大维吾尔族地区置于其统治之下。
一六四三年，准格尔汗国向吐鲁番汗国大举用兵，至一六四四年五月，吐鲁番汗国灭亡。
经过巴图尔和他父亲的不懈努力，准格尔部西攻吉尔吉斯、哈萨克，北御俄罗斯，东攻喀尔喀蒙古，追击土谢图汗和哲布尊丹巴。
准格尔部现已控制天山南北，在西起巴尔喀什湖，北与俄罗斯接壤，东到青海，西南至吹河、塔拉斯河的广大地区，史上最后的游牧帝国正在快速崛起。
历史上准格尔汗国在其继任者噶尔丹的领导下达到历史之最，国土面积达到了七百万平方公里，兵锋已至北京七百里外，康熙不得不宣布北京戒严。
其后准格尔汗国与入关后的满清持续征战七十多年，历康熙、雍正、乾隆三代皇帝。
准格尔汗国鼎盛时期，人口仅有一百多万，精锐骑兵也只有六万，总兵力不过十万。
而当时的满清人口已经上亿，不算地方武装，常备军就有九十多万。
以综合国力而言，双方根本没有可比性，准格尔的不自量力可见一斑。
就是在这样的情况下，准噶尔部仍然与满清对抗了七十多年，可见准格尔汗国也有他自身的优势。
准格尔汗国的特点是地广人稀，而满清在入关后的作战方式却已经发生了转变，后勤补给的重要性凸显。
西北地区路途遥远，而且运输十分困难。清朝建立之初国力有限，没有能力进行长期的战争。
在康熙、雍正时期，只要击退准噶尔部的进攻就可以了，没有力量彻底消灭准噶尔部。