洪武元年，眨眼即逝。
这一年，除了改土归或有战火升起，全国刀兵不动。
趁着这一年难得的平静，赵桓彻底把军队以及军事机构进行了彻底的变革。
历朝历代，都是皇帝直接掌握军队的建置、调动和指挥大权。
但实际上，皇帝是人不是神，自然需要相应的机构来管理指挥军队。
国朝中枢，军权由三个机构分任，分别为枢密院、三衙、以及率臣。
枢密院为最高军事领导机关，掌军权及军令；三衙，即殿前都指挥司、侍卫马军司和侍卫步军司，为中央最高指挥机关，分别统领禁军和厢军；率臣，为禁军出征或镇戍时临时委任的将帅，统领地分属三衙的禁军，事毕皆撤销。
兵符出于枢密，而不得统其众；兵众隶于三衙，而不得专其制。”意即：枢密院有调兵之权，却不掌管军队；三衙掌管军队，却无调兵之权。
这中间，没兵部什么事。
神宗朝前，兵部只负责校阅、仪典、武举事，毫无存在感，改制后，增加了低级官员升迁、调派的职权，只能说稍有改善。
可以说，这样的兵部，直接取消了即不影响朝堂，更不影响军队运转。
在兵力的配置上，国朝军制遵循“强干弱枝，内外相维”的原则。
禁军中最精锐的殿前军驻守在京城，侍卫亲军驻扎在各地，内外数量维持在五五开的局面。
其中京城的人马最为精强，各方镇知道兵力不敌，不敢造反，这就是“强干弱枝”。
如果京城有变，在各地驻扎的禁军联合地方的兵力，也足够对付变乱，这样就“内外相制，无轻重之患”，以达到“内外相维”的目的。
军队主体为禁军、厢兵、乡兵和蕃兵组成，禁军不必多说，乃是主体，至于其他，数额不定，优劣不齐，实在难堪大用。