三部两院是为了保证大汉的正常运转，保证大汉不断壮大，建立一个完整的管理体系，他们的重点将又转移到大汉的建设和壮大之上。
而刘备和陈子明不甘寂寞，又且会就此安养晚年。
所以，在陈子明的建议下，刘备在三部两院之外，另组建军机处。
军机处直属刘备，不属三部两院，不受三部两院的管辖，当然，军机处也没有管理各部的权利，同样受到两院的监督。
军机处不属于大汉常规部门，也就是说，只要刘备愿意，随时都可以解散军机处。
而且军机处没有什么实权，说白了，就是刘备的秘书处和人才储备处，看看里面都是些什么人，便知道他们的作用。
大汉几位最重要的人物：陈子明，郭嘉，关羽，张飞，甘宁，陈宫，太史慈。
谋士：诸葛亮、庞统、法正、贾诩、刘晔、徐庶。
武将：赵云、张辽、徐晃、徐盛、麹义、张绣、张任、庞德、马超、臧霸、张郃、高览、陈到、潘璋。
还有负责情报的王越。
看看军机处的都是些什么人，全部都是大汉的顶级人物，而且都有一个共同的特点，都是刘备的心腹，都是大汉的核心人物。
而且陈子明故意将关羽和张飞放在非常高的位置，也就是说他们两个兄弟几乎没有领兵出征的机会，因为这是陈子明用来征战世界储备人才，凡是统兵打仗，哪有绝对的安全，陈子明觉得还是将这三兄弟留在家中安全点，免得除了意外，连累了大
除此之外，陈子明还建议刘备根据大汉的情况，建立十大军区，将大军分布各地，划定活动范围，同时也好牢牢掌控整个大汉。
在各种规定下，军区大将根本无法成为尾大不掉的诸侯，因为制约他们的规定很多，其中便是各级将领的升迁，皆掌握在军部手中，他们没有权利任命将领。