赤壁之战时，曹操大军南下荆州，刘琮投降，然后才派人通知驻守樊城的刘备。
刘备无力抵抗曹操，不战而走，路过襄阳时，城中十余万百姓自发跟随刘备，致使行军速度非常缓慢。
曹操派遣曹纯率领五千虎豹骑仅用了一天一夜，就在在当阳长阪附近追上了刘备。危急之下，刘备丢下妻子和孩子，仅带着张飞、诸葛亮、赵云等数十骑逃跑，混乱中不见了赵云。
有人对刘备说赵云往北边曹操那里去了，刘备直接用手戟打过去说：“子龙是不会弃我而去的。”
而后，赵云怀抱刘备的幼子刘禅，保护着刘备的妻子甘夫人，平安地回到刘备身边。
此战之后，刘备便任命赵云为牙门将军。
牙门将军是刘备发明的，这个职位需要任职者与主公关系亲近，需要常伴主公左右，参赞军谋，并代为主公统领亲兵。
外军征伐时，牙门将军留守中央，主公亲自征伐时，牙门将军负责统领亲兵作战，说白了就是亲兵统领，保镖。
赤壁之战后，赵云跟随刘备平定荆州南部四郡，刘备任命赵云为偏将军，桂阳太守。
赵范有一个守寡的嫂嫂姓樊，有倾国的美貌，赵范想将她许配给赵云，但是赵云不同意，推辞说：“我们是同姓，你的嫂子就像是我的嫂子一样。”
当时有人劝赵云接受这名美女，赵云回答说：“赵范是被迫投降的，心不可测，何况天下女子不少。”不久之后，赵范果然藉机逃走，而赵云则毫无牵涉。
建安十四年，刘备在平定荆州南部四郡，又得到原属刘表的部曲万人之后，成为荆州牧，声势渐大，孙权建议双方结亲，刘备便娶了其妹孙夫人。
两年之后益州牧刘璋为防备曹操势力而向刘备求援，刘备便领兵三万入益州，留诸葛亮、关羽、张飞、赵云等人留守荆州，并任命赵云为留营司马，管理军事事务。