王敦当上征南大将军，开府建牙，手握重兵，对不服自己的大臣，开始展开杀伐决断，根本不用经过皇帝。
陶侃是个有功劳的将领，但和王敦不是同一路人。于是，王敦便扣押陶侃，将他降为广州刺史，而任命王廙为宁远将军、荆州刺史。
而这个王廙在荆州的做法是，几乎杀光了陶侃的人，为的就是让荆州成为王敦的地盘。
这个做法，导致的结果是“士民怨怒，上下不安”。至于皇帝的话，那就更加怨怒和不安了！
他知道，再让王敦这样无法无天下去，东晋也很快会灭亡的！自己的帝位也会不保！
于是，他把王廙免了，让自己的人去做荆州刺史。
王敦一看皇帝这样做，不知道皇帝的具体心思，要是就此要收拾自己，那自己啥也别说，抄起武器就反了；要是只是对王廙有意见，那自己还可以忍忍。于是，想出一个试探的招数，那就是上表辞职。
其中有些话，说得绵里藏针，敲山震虎，实则是在向皇帝示威。
他说他自己一家特受荣任，备兼权重，渥恩偏隆，宠过公族，就是走在路上的平头百姓，都觉得这样是不行的，我怎么能安心得到这些呢？
这话的内在意思是，百姓们都觉得我权力大了，您皇帝还不更觉得我权力大吗？还不想着废了我？我没有办法了，只有辞职，“以塞群小觊觎之望。”
司马睿又不是傻子，哪里会不知道他的意思？当下忙下诏不许，依然做原职。
他虽然不敢冒然得罪王敦，却也不是任由王敦胡作非为下去的傻子，他想出了对付王氏势力强大的办法，那就是：提拔自己人，挤掉王氏！于是，任命刘隗、刁协、戴渊用事，周顗为尚书左仆射，将领方面，开始重用刘琨、祖逖。目的，自然就是为了疏间王氏。
这一下，连王导也躺着中枪。不过，王导心内虽不平，脸上却装作没事，心里也没想着推翻司马睿，而是用平常人最难接受的法子——忍。