猫难实叮投降后，郑成功命他前往台湾城劝揆一无条件投降，但是，遭到揆一的拒绝。
郑成功与诸将分析形势，认为不给侵略者以迎头痛击，敌人是不肯投降的，于是，他命令军队从鲲鯓南端登陆，“移扎鲲鯓山即一鲲鯓，候令进攻台湾城”。
台湾城是荷兰殖民者在台湾的统治中心，城堡坚固，防御设施完整。城周长200多丈，高3丈多，分3层，下层深入地下1丈多，“城垣用糖水调灰垒砖，坚于石”。城四隅向外突出，置炮数十尊。荷军炮火密集，射程远，封锁了周围每条通道。
城内荷军尚有八百七十人，凭借城堡继续顽抗。
但是赤嵌城被郑军占领之后，台湾城已是一座孤城，城内缺粮、缺水，荷军处境十分困难；加之当时南信风季节刚刚开始，要等待六个月进入北信风季节后，才能将台湾的有关情况告知巴达维亚，然后再等六个月才能利用下一次南信风季节取得巴达维亚的援助，防守更加困难。
郑成功迫降赤嵌城后，为了牵制台湾城荷军，即派兵前往七鲲鯓设伏。
荷军行至七鲲鯓时，还没来得及列阵对垒，即被郑军埋伏的藤牌军冲垮，死伤过半，其余士卒狼狈退回台湾城。
郑成功命令士兵立栅栏、设炮台，加强对七鲲鯓的防守，同时令杨英、何廷斌以粟6000石、糖3000石补给军队。
自四月初以来，双方一直进行着零星战斗。
郑成功一方面积极准备攻城，一方面于四月十二日和二十二日，两次写信给揆一，令其投降。又调集28门大炮，于二十四日凌晨摧毁了台湾城大部分胸墙。
荷军于城上集中枪炮还击，并出城抢夺郑军大炮，被郑军弓箭手击退。
郑成功鉴于台湾城城池坚固，强攻一时难以得手，为了减少伤亡，进一步做好准备，决定采既“围困俟其自降”的方针。