1229年蒙古贵族大聚会,遵照成吉思汗遗命推举窝阔台为大汗。窝阔台即位后,决定亲征金朝,遣大将搠里蛮(又译绰儿马罕)往征波斯。时札兰丁已从印度回波斯,花剌子模旧将及各地诸侯奉他为主,据有波斯西部。搠里蛮急速进兵,1230年冬抵阿塞拜疆,札兰丁从都城桃里寺出奔,次年,为曲儿忒人所杀。搠里蛮军留镇波斯,攻打诸国,谷儿只(格鲁吉亚)、亚美尼亚、鲁迷(小亚细亚的塞尔柱突厥王国)等国先后归附蒙古。搠里蛮死后,由拜住那颜代领其军。
灭金后,蒙古宗王、贵族大会,筹划进兵南宋和远征西域,继续进行征服战争。1235年,窝阔台遣其子阔出统兵攻宋荆襄地区,阔端统兵攻四川,对南宋的战争从此开始。同年,窝阔台又召集大会,定议遣各支宗王长子统兵,出征钦察、斡罗思等国。万户以下各级那颜亦以长子从征;以拔都为西征军统帅,速不台为先锋。1237年,蒙古军灭不里阿耳、钦察,攻入斡罗思。三年之中,**了大部分斡罗思国土。1241年,拔都分兵两路,侵入孛烈儿(波兰)、马札儿(匈牙利)。蒙古军在思格尼茨(今波兰西部)一役,大败孛烈儿、捏迷思(德意志)联军,欧洲震动。1242年,拔都闻窝阔台死讯,率军东返,留驻也的里河下游,统治所征服的钦察、斡罗思等地区。
窝阔台在位期间,大蒙古国的政治、经济制度逐步完备。1229年,制定了蒙古民户的羊马抽分及其他差发制度,限制诸王、那颜任意科取;进一步健全驿站制度,从各千户签调站户当役,规定使臣往来需经由驿路,以免骚扰沿途百姓,乘驿者需持有牌子文字,方许付给驿马、饮食;又命人在沙漠地区掘井,以扩大牧场。1235年,签调汉族工匠,于斡耳寒河(今蒙古鄂尔浑河)旁建立哈剌和林城郭,作为都城。对所征服的定居农业地区,其统治和剥削方式也作了初步改革。窝阔台即位后,即采纳耶律楚材的建议,在中原汉地实行征税办法,规定“汉民以户计,出赋调”,以耶律楚材主管其事。1230年,设立十路课税所,专掌征收钱谷。1234年灭金后,下令检括中原民户,命失吉忽秃忽为中州断事官,主持括户。次年,各路同时编籍户口,总数110多万户,称为乙未(1235年)户籍。按照蒙古分封制度,窝阔台将一部分中原州县民户分赐给诸王、贵戚、功臣为食邑,计70多万户,其余民户则作为皇室共有财产,直属大汗政府。又采纳耶律楚材建议,规定受封贵族只在分地置达鲁花赤监临,由朝廷设官征赋,按其应得份额颁给。分民每两户出丝一斤纳于政府,每五户出丝一斤纳于受封者,称为五户丝。同时制定了各类人户的丁税、地税以及商、盐诸税之法。在西域地区,实行征收丁税的办法,以花剌子模人牙老瓦赤主管其事,并先后设立了管理河中和呼罗珊等地的行政机构。