马克思主义的当代发展要求也造成了研究方式的变化。马克思主义哲学研究方式在这个时段发生了重大的转换，这个转换可以从以下方面来理解。
1.由概念演绎转向关注生活世界
在过去相当长的时期里，我国的哲学理论工作者处于主要解读原著和注释经典的尴尬境地，其主要任务是解读和阐发马克思主义基本原理，阐释那些已经被大家熟悉的理论命题，或使之具体化，在马克思主义哲学的领域内部作一些修补性和细化性的理论探讨，寻求一种逻辑的自洽。这种研究总体上看处于自我循环的境地，以致有人说哲学工作者们常常是自言自语、“自食其果”和自我欣赏，难以有实质性的研究与创新。改革开放以来，思想理论界空前活跃，一方面通过清理概念，澄清命题，重释理论，开拓领域，创建学科等，为深层的理论研究奠定了必要基础；另一方面通过大量翻译和评介国外学术思潮而了解了世界思想理论前沿和学术发展方向，为自主的哲学理论研究提供了背景性条件。在此基础上，我国的理论工作者前所未有地深入到当代中国的社会生活和社会实践之中，关注自然世界、社会世界和人性世界的变化，进一步走进了人们的生活世界、文化世界、心灵世界，与历史与现实开展对话。理论工作者们通过关注对象的变化来促进理论自身的变化，从对象世界的变化中获得了最为丰富的资料，也获得了前所未有的思想活力。
2.由高居于科学之上到走入大科学之中
过去人们把马克思主义哲学看作科学的科学，将其高置于一切科学之上，难以深入到科学之中。由此既难以从科学中吸取营养，也难以指导科学的发展。30多年来，马克思主义研究前所未有地自觉借鉴科学成果与思想方法，走进现代大科学和大技术。马克思主义哲学不仅要帮助人们科学地认识和解释世界，还要帮助人们合理和有效地变革世界，去创造属于人的美好世界，这就需要现代科学技术的支撑。为此马克思主义哲学研究前所未有地与科学结盟，自觉地借鉴现代自然科学，包括人文社会科学的成果，尤其是自觉运用和提升一些跨学科的方法论：从当年马克思主义哲学与信息论、控制论、系统论“老三论”的结合，后来进一步与耗散结构、循环论、突变论“新三论”结合，直至今日与现代系统科学和复杂性科学群的对话。正是借助于复杂性科学的理论、思路和方法，马克思主义哲学获得了一种特殊的能力，能够从事对于复杂性问题的深度解读和批判性反思，并在人类实践中发挥更加积极和有效的作用。