自愿戒毒作为与社区戒毒、强制隔离戒毒、社区康复戒毒并存的戒毒措施，经长期不断的实践摸索，体现出它独有的应用效果，当然也暴露了它存在的问题和不足之处，需要加以解决并不断发展，以更好地发挥它在戒毒工作中的作用。
一、自愿戒毒的应用效果
（1）吸毒者通过戒毒医疗机构进行戒毒治疗，往往是自行交费，从而有利于在一定程度上减轻强制戒毒、社区戒毒或社区康复的压力，减少国家在禁毒戒毒方面开展工作投入的人力和财力。
（2）有利于鼓励隐性吸毒者自行进行戒毒。我国除却已登记在册的庞大吸毒群体之外，仍有相当一部分吸毒人群未曾登记在册，此类人群不愿暴露自己的吸毒行为，通过自愿戒毒可以满足其不被他人知晓的心理状态，从而帮助其走入戒毒医疗机构进行自我戒毒。
（3）戒毒医疗机构的医疗队伍专业能力较强，更能通过先进的医疗方法对戒毒人员进行戒毒治疗，更能体现科学戒毒的立法宗旨。
二、自愿戒毒存在的不足之处
（1）戒毒费用过高，许多戒毒者无法承担。自愿戒毒医疗机构对自愿戒毒者的戒毒治疗是收取费用的，这些费用往往是由戒毒者或其亲属自行承担。有的戒毒医疗机构变相谋取利益，收取过高费用，而吸毒人员大多本身因为前期的吸毒行为已经耗费了大量的钱财，如因自愿戒毒而需交纳过高费用，很大部分戒毒者都会因无法承担巨额的费用而选择放弃。
（2）戒毒医疗机构的戒毒治疗往往侧重于脱毒治疗而忽视心理康复和社会功能的恢复。自愿戒毒的治疗内容包括生理脱毒、心理康复和社会功能三项内容，而戒毒医疗机构由于其具有的营利性、场所范围有限、治疗队伍以医疗队伍为主，缺乏心理咨询师、技能培训师等特点而导致其治疗重点仅在于帮助戒毒人员脱离生理毒瘾，而对于另外两项则基本忽视，即使有所涉及，也是浅尝辄止，不能够深入开展。