（一）明确责任，完善管理体制
自1993年《中国教育改革和发展纲要》提出我国高等教育实行中央和省两级管理、以省为主的管理体制后，在多年改革试点的基础上，按照“共建、调整、合作、合并”等多种形式，原中央部委管理的400多所学校除少数归教育部管理外，大部分下放由省级政府管理。到2000年，高校管理体制改革任务基本完成。这对于明确政府责任，打破条块分割，优化资源配置，有很大的促进意义。按照这种体制运行十余年来，河南省高等教育事业得到了较快发展，到2010年高校数达107所，在校生数达146万人，比1998年的51所高校和14.6万人分别增长1.1倍和9倍。但这种管理体制也存在着中央财力对地方政府支持不够，省级政府财政负担过重，市级政府责任不明，学校自身发展压力过大等许多不足。为此，需要进一步完善高校管理体制。
1.加大中央财政对地方财政的转移支付力度
一是中央财力增强，有能力加大转移支付。据国家统计局发布的2010年国民经济和社会发展统计公报显示，我国财政收入已达83080亿元，占当年GDP（397983亿元）的20.8%，其中中央本级收入42470亿元，占财政总收入的51.1%，地方收入40610亿元，占48.9%。而2000年我国财政收入只有13395亿元，占GDP的比例仅有13.5%。因此，国家财力总量增大，中央本级财政收入增加，中央财政的调控能力增强，有能力加大对地方财政的转移支付。
二是教育投资的外溢性应该得到补偿。2006年，中部各省份人口迁出率均值为14.05%，西部各省份均值为17.9%，均高于东部各省份均值11.06%[1]。据统计，河南省人口总量为1亿，常年在外务工人员达1500万人，表明河南省人口迁出率较高，面临的财政外溢现象最为严重。因此，中央财政应该加大对河南省等财政外溢较多省份的支持力度，对地方教育投资尤其是高等教育投资进行代偿。