综合实践活动课程是学生最为自主、最为自由的课程，然而在课程的实施过程中，教师仍然起着非常重要的作用。因为对于小学生而言，不仅是在知识结构方面，还是在人生阅历方面，他们都还不够成熟，教师的指导是不可或缺的部分。可以说，没有教师的指导，学生的学习就会困难重重，甚至会走很多弯路。
综合实践活动课程的师资来源非常广泛，可以是学校的教师、社会的相关人士，也可以是学生家长代表。需要特别说明的是，学校的各门学科的教师也都可以是综合实践活动课程的指导教师。虽然综合实践活动课程不像学科课程一样，需要有专业的科任老师，且课程本身具有较强的综合性，但单靠一两个教师也是无法完成的，原则上需要各科教师的配合。因此，可以说学校里的任何一个学科教师（包括语文、数学、科学、音乐、美术、体育等）都是综合实践活动课程的指导教师，都有着指导综合实践活动课程实施的责任。《综合实践活动指导纲要》指出：“在教师指导方式上，综合实践活动倡导团体指导与协作教学。不能把综合实践活动的指导只赋予某一学科的教师、班主任或专门从事综合实践活动课程的教师，而应通过有效的方式将所有教师的智慧集中起来，对综合实践活动进行协调指导。”这种教师指导体制，不局限于班级、学年、学科的组织形式，可以是几个教师“教一门课程”，也可以是寻求不同学年、不同学科之间的相互协作。总之，需要调动学校全体教师的积极性，鼓励大家共同参与综合实践活动课程的指导。
同时，学校还要广泛吸收社会上各行各业的知名人士、专家、教授及有兴趣者参加，形成“人人了解综合实践活动课程，个个指导综合实践活动课程，大家积极服务于综合实践活动课程”的现象。当然，学校教师才是综合实践活动课程中师资群体的主体，活动主题的选择、设计、实施、评价、总结等，都是由学校指导教师完成的。而社会人士也可以就方案的可行性，特别是对活动的某一环节进行重点指导。