目前，现有民办中小学的资金来源仍比较单一，学校发展受办学资金制约的状况较为突出。根据分类管理政策，义务教育阶段民办学校必须为非营利性学校，高中阶段民办学校分类登记，这有利于进一步落实政府扶持民办小学、初中、非营利性高中的优惠政策，吸引社会捐赠；同时促使营利性民办高中利用自身特点多途径吸引更多社会资金。民办中小学经费来源结构将趋于多元化。
（一）政府投入与扶持进一步落实到位
随着我国教育经费持续增加，以及民办教育逐步走向正规化，各地政府逐步增加奖励或直接加大对民办中小学的资金投入。特别是义务教育阶段，各级政府履行基本教育公共服务职责，探索以购买服务等方式加大对民办中小学的扶持力度。比如，近年来很多地方通过专项资金等方式扶持本地区民办中小学发展。2013年合肥市投入专项资金3600万元扶持民办学校发展，2400万元用于奖励在招生、就业（毕业）等方面取得优异成绩的民办学校，1200万元用于校舍安全工程补贴。在2400万元奖励中，800万元为民办基础教育发展专项资金，用来推进民办基础教育（含小学、初中、高中）的发展；1600万元为民办中等职业学校发展专项奖，用来提升中等职业学校整体办学实力，并对达到一定办学规模的民办职业学校给予奖补。[21]
《促进民办教育健康发展的若干意见》（2016年）明确要求，各级人民政府因地制宜，加大对民办教育的扶持力度，建立健全政府补贴制度，完善政府购买服务的标准和程序，设立地方民办教育发展基金，明确民办学校学生与公办学校学生按规定同等享受助学贷款、奖助学金等资助政策，确定非营利性民办学校与公办学校享有同等待遇等。随着分类管理深入推进，民办教育分类扶持制度体系将进一步优化，为政府投入与扶持进入清理制度障碍，这无疑将进一步提高政府投入在民办中小学经费来源中的比例。