独立的丧失，土地被剥夺，沉重的赋税负担、劳役和兵役，必然会激起两河流域人民的反抗斗争。公元前522年，在当冈比西斯在埃及时，在波斯国内发生了推翻冈比西斯统治的事件，最后大流士攫取了王权。这时两河流域人民和波斯统治下的其他地区人民掀起了反对大流士统治和波斯人统治的斗争。在大流士的《贝希斯吞铭文》中说：
当冈比西斯向埃及出发的时候，人民**起来，在国内，在波斯，在米底，也在其他各省，发生了巨大的恶祸。以后出现了一个人，僧侣玛哥斯，名高墨塔，他在庇什亚瓦德，在名为阿尔卡德里什山的地方暴动了……于是所有的人民，波斯、米底以及其他诸省都**起来，从冈比西斯转而倾向于他。
在大流士夺取了王权以后，包括巴比伦在内的各省人民再次起义反对波斯人的统治。在《贝希斯吞铭文》中说：
当我杀死了僧侣高墨塔之时，有一个人，名阿辛那，乌帕达尔马之子，在埃兰暴动了……还有一个巴比伦人，名尼金图·贝尔，阿尼里之子，在巴比伦暴动了。他这样欺骗人民说：“我是尼布甲尼撒，那波尼德之子。”这时巴比伦人民全部转向这个尼金图·贝尔。巴比伦**起来了，而他在巴比伦取得了政权……此后，我向巴比伦出发攻打自称为尼布甲尼撒的尼金图·贝尔。尼金图·贝尔的军队占据了底格里斯河。他的军队停在那里，船队也就停在那里。于是我令军队坐在皮筏上，另一部分坐在骆驼或马上。阿胡拉·马兹达帮助了我。按阿胡拉·马兹达的意旨，我们渡过了底格里斯河。在那里粉碎了尼金图·贝尔的军队。这是在阿西亚吉加月二十四日，我们进行了会战。此后，我前往巴比伦。在未到达巴比伦之前，在幼发拉底，那里有一个名为扎赞那的城市，那个自称为尼布甲尼撒的尼金图·贝尔带领军队来到这里，要与我会战。以后我们进行了战斗。阿胡拉·马兹达帮助了我。按阿胡拉·马兹达的意旨，我粉碎了尼金图·贝尔的军队。敌人被赶入了水中。水把它带走了。这是在阿那马卡月二日，我们进行了会战。尼金图·贝尔带领少数的骑兵逃到巴比伦。于是我开往巴比伦。按阿胡拉·马兹达的意旨，我占领了巴比伦并擒获了尼金图·贝尔。以后我把这个尼金图·贝尔杀死在巴比伦。