近几年来，高校文物类资产管理的质量不高，方法落后，基础工作薄弱，规章制度不健全，岗位责任不明确，会计监督和核算不力，造成国有资产有形与无形流失严重，具体表现在以下几个方面。
（一）高校文物类资产“底数”不清，账目混乱
高校作为一个传承文化的场所，在漫长的办学过程中逐步形成了一定量的高校文物资产。由于建校历史长，藏品来源渠道庞杂，人员变化频繁等客观原因，高校文物类资产“底数”不清。在文物及陈列品固定资产的认定上相关的制度和文件不全，校内固定资产认定的流程之间衔接并不紧密，容易在会计账面上没有得到及时的确认，甚至是重复入账。长期以来，藏品管理不规范，人治管理，各管一摊，由于缺乏必要的、细致的交接手续，人员发生变动时，其他人就不清楚库存情况。
（二）对文物类资产进行清查盘点存在局限性
高校进行文物类资产清查盘点存在不好操作的问题。《文物事业单位财务制度》规定：“财务部门应当定期与保管部门进行文物资产清查盘点，重点要核对文物藏品资产账面数、文物藏品登记账数和实物，确保文物藏品的数量、名称和实物一一对应。”该款规定难以执行。对文物类资产进行清查盘点，盘点人要具备一定的文物专业素质，要非常清楚藏品情况。但高校资产管理人员不是文物专业技术人员，其掌握信息不足，如此一来，建立健全文物藏品的监督管理制度就会打折扣，而要求其定期进行文物类资产清查盘点基本上也做不到。
（三）高校文物类资产保管不专业，内控制度不完善
很多高校对藏品的保管措施不科学，没有根据藏品的种类、级别、质地等，采取不同的保护和管理措施，而是对所有的藏品都使用一种方式，这不利于藏品的保护和管理。金属腐蚀，石雕风化，木材干裂，纸张老化等，也是造成资产流失的客观内容之一。高校普遍缺乏文物的内部控制制度。内部控制制度是一种防范制度，可以使相关部门相互牵制，如果不建立和执行内部控制制度，可能会出现拿钱拿物甚至贪污的情况。