专著：
1.《秦汉史略》，上海人民出版社，1955年版。
2.《中国古代及中世纪史讲义——秦汉至唐中叶》，北京师范大学出版社，1957年版。
3.《魏晋南北朝史略》，上海人民出版社，1958年版。
4.《读史集》，上海人民出版社，1982年版。
5.《中国古代社会》，河南人民出版社，1991年版。
6.《中国通史·魏晋南北朝时期》，上海人民出版社，1994年版。
7.《爱国一书生：八十五自述》，华东师范大学出版社，1997年版。
8.《何兹全文集》六卷本，中华书局，2006年版。第一卷：中国社会史论、第二卷：中国史综论、第三卷：《中国古代社会》、第四卷：《中国古代及中世纪史讲义》《中国文化六讲》、第五卷：《秦汉史略》《三国史》、第六卷：《爱国一书生》杂著等。
9.《中国文化六讲》，北京大学出版社，2008年版。
10.《三国史》，人民出版社，2011年版。
学术论文：
1.《中古时代之中国佛教寺院》，《中国经济》第2卷第9期，1934年。
2.《魏晋时期庄园经济的雏形》，《食货》半月刊创刊号，1934年12月。
3.《南北朝隋唐时期的经济与社会》，天津《益世报·食货周刊》，1937年5月18日。
4.《魏晋南朝的兵制》，《历史语言研究所集刊》，第16本（1948年1月）。
5.《关于中国古代社会的几个问题》，《文史哲》，1956年第8期。
6.《从城乡关系看两汉和魏晋南北朝社会经济的变化》，《北京师范大学学报（人文社会科学版）》，1958年第2期。
7.《北魏文明太皇太后——中国历史上一位女政治家》，《北京师范大学学报（人文社会科学版）》，1961年第4期。
8.《读〈府兵制度考释〉书后》，《历史研究》，1962年第6期。