上回说到大主教麦克莱恩鼓动如簧之舌，在教皇面前搬弄是非，于是伽利略大难临头。几天后，他身戴枷锁被从千里外的佛罗伦萨押到了罗马。这时他已到六十六岁的迟暮之年，诸病缠身，朝不保夕。本来医生说，伽利略可能等不及到罗马，就会在路上消失到另一个世界去。可是教皇说，就是死了，也要押来受审。他的朋友们曾劝他逃走，并准备好了车马，可是伽利略说：“我是一个虔诚的教徒，我应该到罗马去当面把这一切说清楚。”
这天，伽利略被押到宗教裁判所，颤巍巍地站在被告席上。主教麦克莱恩阴沉着脸坐在案后，还不等伽利略喘过气来，便拾起一本书在桌上“啪”地拍了一声，喝道：“伽利略，这本宣传异端的东西，可是你写的吗？”
伽利略不需细看，便知道他摔的正是那本《对话》，便说：“主教大人，书是我写的，但那并不是什么异端邪说。序里开头说得明白，那不过是一种假想。再者书中的三个人物，各代表一种观点，自由讨论，亚里士多德的代言人辛普利耶也在充分发言啊！”
主教一声冷笑：“伽利略，你真会诡辩，你让辛普利耶代表亚里士多德说话，可是，你同时又借那两个狂徒的口百般讽刺挖苦他。你既然是一个虔诚的教徒，为什么又攻击圣经上写明的道理？”
伽利略有点激动了，他抖动着满脸银须，大声反驳道：“科学发展到今天，从望远镜里已经看到许多新证据，我只不过如实将这些写出来供大家讨论，而您连这也不允许，这分明是要一个科学家去背弃自己的感情和那些无可否认的事实。这是你们在制造异端！”
伽利略努力使自己的情绪镇静下来。然后，他以自己对教会的虔诚，历数许多新证据，从各种角度对圣经进行解释，并且他一再说明，这只是假设，是为了讨论问题方便，绝无宣传邪说之意。他说得口干舌燥，眼睛里噙着泪花，虔诚之中掩藏着愤怒。他愤怒于胸却又不敢直陈于口，但是又决不甘于投降认罪，他站在那里内心矛盾，两手发抖，脸涨得通红。他尽腹内所有的学识，努力掌握着一定的分寸，与主教大人进行着马拉松式的辩论。从上午开庭，一直这样辩论到暮色苍茫，直到教堂的天窗上那最后一缕阳光也已消失，还是没有任何结果。