陈祖义押回南京，下场只有一个，那就是死！永乐帝在各国使者的面杀掉了陈祖义，将其斩首示众，警示他人。陈祖义有这个下场，也是咎由自取。
由于陈祖义海盗团的横行，大明与南洋诸国的贸易和来往受到了严重的阻碍，大明的商船也是损失惨重。更糟糕的是，陈祖义做了一个很坏的榜样，沿海的很多民众都有样学样，不是去投靠陈祖义就是自己做海盗，闹得南洋很不安宁。
其实，陈祖义之前也不是没有求得大明皇帝宽恕的机会。当陈祖义成为渤林邦国国王的时，只要他肯向大明认罪，并不再劫掠过往船只，攻陷沿海城镇，大明按照惯例就会封他一个官职，承认他在南洋的地位与领土。郑和一开始也有招安之意，不管怎么说，陈祖义也是大明人，成为番邦小国之主，也算为大明争光。
这样的事也是有先例的，同在苏门答腊岛三佛齐王就是一个很好的例子。洪武三十年，爪哇满者伯夷国王灭三佛齐旧王朝，国中大乱；当时旅居三佛齐的汉人一千多人拥戴广东南海人梁道明为三佛齐王。梁道明王领兵守卫三佛齐北方疆土，对抗满者伯夷。十年间有几万军民从广东渡海投奔梁道明王。永乐三年，永乐帝派梁道明国王的同乡监察御史谭胜受和千户杨信带敕前往招安；梁道明国王和臣子郑伯可一同入朝贡方物，留下副手施进卿带领众军民。梁道明受招安后回到了老家，得到了永乐帝丰厚的赏赐，而他的副手施进卿则成了旧港汉人的首领。
如果陈祖义真的接受招安，那他也不是有现在这个下场。可偏偏陈祖义吃了熊心豹子胆，也可能是在南洋横行惯了，谁都不放在眼里，所以陈祖义才趁郑和第一次下西洋回航时打算动手，利用诈降来偷袭郑和的船队，打算打捞一笔。而他最后的结果当然是失败了，就这么被带回大明斩首。