五月五日，两派军队首次交战，上杉景虎和妻子逃出春日山城，进入山内上杉宪政的居城御馆城。上杉景胜马上引军包围御馆城。
上杉景虎的兄长北条氏政向武田胜赖求助，武田胜赖答应五月二十九日进军上杉境内。
然而上杉景胜以一部分领土割让、黄金一万两、并娶武田胜赖的妹妹为妻等一系列条件使武田胜赖答应退兵。（一说是景胜以黄金两千两贿赂胜赖的重臣长坂长闲、迹部大炊助）北条氏政见武田家退兵，9月北条方氏照、氏邦出阵，攻入上杉境内。越后桦泽城、坂户城以及邻近诸城落城。
上杉谦信的死让反抗织田武田的联军气势一滞，特别是爆发“御馆之乱”，这导致甲相越三国同盟出现破裂，由于北条氏政出兵援助上杉景虎，武田胜赖失去了两大援助。
因此，武田正信觉得进攻武田胜赖的时机已经到了。
不过，本多正信出言道：“将军殿下，尽管上杉家因为家督的位置出现内乱，但要是我军此刻出兵的话，只会引起武田胜赖，北条氏政两人的警觉。
到时候三方一定会在最短的时间内结束上杉家的内乱，来抵抗我军。所以臣以为，应当在上杉家的内乱中，扶持弱者，夺取最大的利益。”
武田正信每天微皱：“官兵卫，你也是这么想的吗？”
黑田孝高迟疑了一下，随后点头道：“是的，殿下，臣也是这么认为，进攻武田胜赖的事情还需要缓一缓。”
武田正信见两位军师都不同意出兵的事宜，说道：“既然这样的话，那就派人去联系上杉景虎，告诉他，只要他同意带领越后归附幕府，他就是东越后的藩主。”
本多正信依照武田正信的命令派遣使者秘密前去御馆面见上杉景虎，此刻的上杉景虎还有一些支持者，就连上杉军中猛将北条景广也站在上杉景虎这边。所以上杉景虎并没有同意武田正信的条件。