殷正茂得知花腰峰已被稳住，梁有训已从金锡都撤退，当即率亲兵三千出了惠州城，到前线督师，设行辕于潮阳县东南二十里的海门城。
海门城始建于洪武年间，坐临大洋，城墙高两丈，周围九百七十丈，有四门，乃海防要塞，殷正茂在城内千户所千户署设下军帐，传檄俞大猷、王诏两路大军同时向马耳澳进发。
传令中军刚要出发，许瑞拦住，对殷正茂道：“军门，时下海上多西南风，从海丰来者顺风，一二日可到马耳澳；由铜山去马耳澳为逆风，两军应审风势，约期同时到达，不的，不是被林道乾各个击破，就是让他逃脱。”
“喔呀！差点误了大事！”殷正茂猛醒，“你给掐算下时日，再传檄。”
此时，梁有训已回到马耳澳，向林道乾禀报了官军动向。
“他郎奶的，不能坐以待毙，老子给他来个出其不意！”林道乾吐了口唾沫道。
“大帅说的是。”梁有训道，“我当东去，与俞大猷一战，若胜则回师对付王诏，若不敌，可遁去外洋，再作计较。”
计定，林道乾率大船五十艘、小船八十艘，倾巢出动，向铜山突袭。
俞大猷接到殷正茂的令檄，率大小船一百零五艘，将士万余，排成扇形，向马耳澳围拢而来，刚出铜山，忽闻林道乾海船冲来，急命迎战。自随佛朗机人追击林道乾，惊诧于佛朗机战船火器的厉害，俞大猷在战船上，就设置了仿古火器之制制成的铁棒雷飞、母子火兽等炮，另有最能及远的涌珠大炮。遂下令以火炮向敌船猛轰。
林道乾在海上多年，身经百战，手下喽啰又习于海，操纵舟船甚是谙熟、灵活，遂以小舟四处突袭，两军激战，火光冲天，海浪四溅。
激战一昼夜，难分胜负，梁有训建言道：“大帅，看这阵仗，不必恋战，向拓林撤退吧！”